[24-25 Juni 2022] Workshop Docking Molekul Tingkat Dasar Batch 2

Yth Bapak/Ibu,

Mohon ijin share kegiatan PUI-PT TropBRC IPB

Workshop Docking Molekul Tingkat Dasar Batch 2

Hari/tanggal: Jumat-Sabtu / 24-25 Juni 2022

Tempat: via Zoom Meeting

Waktu: 08.00 - 17.00 WIB

MATERI:

- Pengenalan Struktur Protein, Sekuen Fasta, PDB Bank dan Database Uniprot

- Pemilihan, Visualisasi dan Preparasi Struktur 3D Protein untuk Docking

- Pencarian Ligan, Optimasi Geometri dan Preparasi Ligan

- Re-Docking sebagai Validasi

- Cross-Docking dengan Ligan Uji

- Analisa Hasil Docking

SOFTWARE YANG DIGUNAKAN

- Rigid Docking dengan Autodock Vina

- PyMOL 2.5

- Autodock Vina 1.2

- Autodock Tools 1.5.7

- Orca 5.1

PEMBICARA:

Dr. Setyanto Tri Wahyudi, SSi., MSi 

(TropBRC LPPM IPB; Departemen Fisika FMIPA IPB)

PERSYARATAN:

• Laptop atau Desktop minimal Core-i3 atau AMD yang setara (lebih tinggi lebih baik)

• Memory 4 GB (lebih tinggi lebih baik)

• OS Windows 10 dan/atau OS Windows 11. (Untuk OS MacOS bisa digunakan, namun untuk instalasi menjadi tanggung-jawab praktikan)

FASILITAS :

1. Disediakan Program-Program Simulasi (free dan Academy/Edu-licensed)

2. Modul Praktikum

3. Rekaman Workshop

4. Sertifikat

BEFORE & AFTER SERVICE:

1. Monitoring Instalasi Program sebelum Acara Workshop

2. Problem-Solving setelah Acara Workshop

BIAYA

Early bird Rp 1.000.000,- (hari ini 18 Juni 2022)

Rp 1.250.000,-/peserta

Kuota terbatas: 25 peserta

link registrasi: https://ipb.link/wstropbrc0622

CP: Tiest (WA Only wa.me/628156641396)

COMING SOON:

• WS Docking Tingkat Menengah  (Jadwal Tentatif, Kuota Terbatas 25 peserta)

Materi Batch 1: Virtual Screening, Analisa DrugLikeness dan Bioactivity, Blind vs Targeted Docking, Prediksi Binding Site, Flexible Docking, Docking dalam Air, Docking dengan Ligan yang mengandung Logam.

Materi Batch 2: Prediksi Struktur Peptida dan Protein, Protein-Protein docking, Peptida Docking

• WS Docking Tingkat Lanjut (Jadwal Tentatif, Kuota Terbatas 25 peserta)

Materi: Pengenalan Simulasi Dinamika Molekul, Pembuatan Ensemble Struktur Protein, Ensemble Docking.

Terimakasih, salam.